23 de enero, Por segundo año consecutivo SkyTeam fue reconocida porGlobal Traveler Magazine, como la Mejor alianza de aerolíneas de 2006.
2 de febrero, SkyTeam firmó acuerdos con Air Europa, Copa Airlines y Kenya Airways, los cuales indican que estas líneas aéreas han iniciado el proceso para convertirse oficialmente en aerolíneas asociadas. Tales acuerdos constituyen un paso formal en el proceso de incorporación de asociados en la alianza y reafirman el compromiso de cumplimiento de los estándares por parte de estas compañías aéreas para ser reconocidas oficialmente como aerolíneas asociadas.
4 de junio, SkyTeam ha designado a Leo van Wijk como su primer presidente del directorio de la alianza. El anuncio se realizó durante la reunión de la Junta Directiva de SkyTeam en Vancouver.
4 de septiembre, SkyTeam anunció los tres primeros miembros de su Programa de asociados, Air Europa, Copa Airlines y Kenya Airways. Los pasajeros que viajen con estas tres aerolíneas recibirán a partir de ahora todos los beneficios de SkyTeam, incluyendo la posibilidad de acumular y canjear millas por sus vuelos y acceso a los salones VIP de los aeropuertos.
15 de noviembre, China Southern Airlines se transformó oficialmente en el 11er miembro de SkyTeam, de esta manera, la alianza es la primera en incorporar una aerolínea de China continental. Con la integración de China Southern Airlines, SkyTeam brinda actualmente sus servicios a una cantidad aproximada de 428 millones de pasajeros por año a través de un sistema de 16.400 vuelos diarios alrededor del mundo y con una cobertura de 841 destinos en 162 países.